Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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CCDC142Q17RM4 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
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CCDC142Q17RM4 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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CCDC142Q17RM4 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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CCDC142Q17RM4 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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CCDC142Q17RM4 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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CCDC142Q17RM4 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
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CCDC142Q17RM4 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
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CCDC142Q17RM4 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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CCDC142Q17RM4 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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CCDC142Q17RM4 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CCDC142Q17RM4 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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