Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
LONRF1Q17RB8 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LONRF1Q17RB8 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 291.9 ms