Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN21Q16825 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPN21Q16825 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.8 ms