Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ME3Q16798 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ME3Q16798 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ME3Q16798 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ME3Q16798 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ME3Q16798 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ME3Q16798 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ME3Q16798 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ME3Q16798 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ME3Q16798 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ME3Q16798 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ME3Q16798 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ME3Q16798 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ME3Q16798 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ME3Q16798 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ME3Q16798 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ME3Q16798 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ME3Q16798 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ME3Q16798 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ME3Q16798 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ME3Q16798 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ME3Q16798 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ME3Q16798 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ME3Q16798 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ME3Q16798 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ME3Q16798 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ME3Q16798 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ME3Q16798 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ME3Q16798 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ME3Q16798 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ME3Q16798 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
ME3Q16798 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ME3Q16798 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ME3Q16798 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ME3Q16798 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ME3Q16798 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ME3Q16798 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ME3Q16798 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ME3Q16798 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ME3Q16798 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ME3Q16798 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ME3Q16798 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ME3Q16798 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ME3Q16798 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ME3Q16798 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ME3Q16798 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ME3Q16798 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ME3Q16798 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ME3Q16798 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ME3Q16798 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ME3Q16798 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ME3Q16798 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ME3Q16798 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ME3Q16798 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ME3Q16798 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ME3Q16798 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ME3Q16798 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ME3Q16798 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ME3Q16798 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ME3Q16798 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ME3Q16798 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ME3Q16798 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ME3Q16798 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ME3Q16798 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ME3Q16798 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ME3Q16798 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ME3Q16798 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ME3Q16798 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ME3Q16798 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ME3Q16798 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ME3Q16798 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ME3Q16798 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ME3Q16798 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ME3Q16798 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ME3Q16798 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ME3Q16798 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ME3Q16798 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ME3Q16798 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ME3Q16798 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ME3Q16798 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ME3Q16798 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ME3Q16798 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ME3Q16798 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ME3Q16798 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ME3Q16798 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ME3Q16798 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ME3Q16798 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ME3Q16798 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ME3Q16798 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
ME3Q16798 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
ME3Q16798 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ME3Q16798 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ME3Q16798 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ME3Q16798 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ME3Q16798 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ME3Q16798 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ME3Q16798 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ME3Q16798 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ME3Q16798 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
ME3Q16798 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms