Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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