Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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SGCBQ16585 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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