Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RPE65Q16518 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms