Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
TNXAQ16473 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
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TNXAQ16473 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
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TNXAQ16473 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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TNXAQ16473 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TNXAQ16473 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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