Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NTRK3Q16288 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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