Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
CNGA3Q16281 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNGA3Q16281 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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