Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
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SCN9AQ15858 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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SCN9AQ15858 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
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SCN9AQ15858 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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SCN9AQ15858 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
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SCN9AQ15858 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SCN9AQ15858 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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