Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TWIST1Q15672 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
TWIST1Q15672 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TWIST1Q15672 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TWIST1Q15672 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TWIST1Q15672 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TWIST1Q15672 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TWIST1Q15672 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWIST1Q15672 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWIST1Q15672 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWIST1Q15672 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWIST1Q15672 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWIST1Q15672 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWIST1Q15672 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWIST1Q15672 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWIST1Q15672 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWIST1Q15672 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWIST1Q15672 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWIST1Q15672 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TWIST1Q15672 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWIST1Q15672 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWIST1Q15672 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TWIST1Q15672 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWIST1Q15672 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWIST1Q15672 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWIST1Q15672 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWIST1Q15672 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWIST1Q15672 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TWIST1Q15672 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWIST1Q15672 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWIST1Q15672 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TWIST1Q15672 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWIST1Q15672 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TWIST1Q15672 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWIST1Q15672 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWIST1Q15672 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWIST1Q15672 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWIST1Q15672 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWIST1Q15672 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWIST1Q15672 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWIST1Q15672 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TWIST1Q15672 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
TWIST1Q15672 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TWIST1Q15672 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
TWIST1Q15672 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TWIST1Q15672 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
TWIST1Q15672 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TWIST1Q15672 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TWIST1Q15672 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TWIST1Q15672 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TWIST1Q15672 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TWIST1Q15672 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TWIST1Q15672 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TWIST1Q15672 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TWIST1Q15672 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms