Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
NEDD9Q14511 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NEDD9Q14511 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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