Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
COL9A3Q14050 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
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