Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
PDE6HQ13956 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PDE6HQ13956 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms