Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.39
CACNA1CQ13936 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
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