Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
ATP1A4Q13733 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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