Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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PRPF4BQ13523 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
PRPF4BQ13523 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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