Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC0.81□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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TMED1Q13445 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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TMED1Q13445 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
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TMED1Q13445 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
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TMED1Q13445 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
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TMED1Q13445 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
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TMED1Q13445 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
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TMED1Q13445 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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TMED1Q13445 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TMED1Q13445 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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