Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.69
SF3B2Q13435 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SF3B2Q13435 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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