Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.97□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
XRCC4Q13426 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.96□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
XRCC4Q13426 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
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