Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
MSLNQ13421 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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