Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
PDE3BQ13370 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PDE3BQ13370 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
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