Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CLN3Q13286 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
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