Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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IFT88Q13099 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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IFT88Q13099 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
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IFT88Q13099 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
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IFT88Q13099 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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IFT88Q13099 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
IFT88Q13099 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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