Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
STRN3Q13033 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.6 ms