Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
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GTF3C1Q12789 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
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GTF3C1Q12789 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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GTF3C1Q12789 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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GTF3C1Q12789 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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GTF3C1Q12789 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
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GTF3C1Q12789 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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GTF3C1Q12789 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
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GTF3C1Q12789 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GTF3C1Q12789 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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