Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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HOXC5Q00444 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC0.8□□□□□ -2.28
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HOXC5Q00444 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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HOXC5Q00444 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
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