Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CITED1Q99966 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CITED1Q99966 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122 ms