Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRAPPC9Q96Q05 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms