Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
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TRIM63Q969Q1 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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TRIM63Q969Q1 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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TRIM63Q969Q1 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
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TRIM63Q969Q1 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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TRIM63Q969Q1 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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TRIM63Q969Q1 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
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TRIM63Q969Q1 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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TRIM63Q969Q1 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
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TRIM63Q969Q1 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
TRIM63Q969Q1 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
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