Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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USP43Q70EL4 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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USP43Q70EL4 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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USP43Q70EL4 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
USP43Q70EL4 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
USP43Q70EL4 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP43Q70EL4 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP43Q70EL4 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP43Q70EL4 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP43Q70EL4 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP43Q70EL4 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP43Q70EL4 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP43Q70EL4 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP43Q70EL4 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP43Q70EL4 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP43Q70EL4 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP43Q70EL4 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP43Q70EL4 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USP43Q70EL4 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP43Q70EL4 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP43Q70EL4 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USP43Q70EL4 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP43Q70EL4 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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USP43Q70EL4 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USP43Q70EL4 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USP43Q70EL4 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP43Q70EL4 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USP43Q70EL4 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USP43Q70EL4 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USP43Q70EL4 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USP43Q70EL4 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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USP43Q70EL4 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP43Q70EL4 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP43Q70EL4 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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