Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC114752.1-201ENST00000448204 289 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
ANKRD39Q53RE8 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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