Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CDO1Q16878 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.2 ms