Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
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SGCAQ16586 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
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SGCAQ16586 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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SGCAQ16586 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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SGCAQ16586 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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SGCAQ16586 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
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SGCAQ16586 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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SGCAQ16586 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SGCAQ16586 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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SGCAQ16586 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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SGCAQ16586 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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SGCAQ16586 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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SGCAQ16586 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
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SGCAQ16586 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SGCAQ16586 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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