Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.06□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC0.05□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
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ZFHX3Q15911 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ZFHX3Q15911 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC0.03□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.41
ZFHX3Q15911 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.41
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