Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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SCN9AQ15858 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
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SCN9AQ15858 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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SCN9AQ15858 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SCN9AQ15858 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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