Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC0.31□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC0.29□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.28□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC0.28□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC0.28□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.36
NEDD8Q15843 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NEDD8Q15843 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
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