Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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PTPRKQ15262 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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PTPRKQ15262 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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PTPRKQ15262 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
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PTPRKQ15262 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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PTPRKQ15262 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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PTPRKQ15262 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
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PTPRKQ15262 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTPRKQ15262 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
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