Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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BRD3Q15059 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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BRD3Q15059 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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BRD3Q15059 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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BRD3Q15059 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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BRD3Q15059 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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BRD3Q15059 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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BRD3Q15059 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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BRD3Q15059 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
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BRD3Q15059 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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BRD3Q15059 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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BRD3Q15059 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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