Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
HERC3Q15034 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
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