Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC-0.13□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC-0.13□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
SHPRHQ149N8 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
SHPRHQ149N8 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
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