Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
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GPNMBQ14956 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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GPNMBQ14956 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
GPNMBQ14956 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
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GPNMBQ14956 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GPNMBQ14956 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
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