Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
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CHD4Q14839 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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CHD4Q14839 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CHD4Q14839 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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CHD4Q14839 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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CHD4Q14839 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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CHD4Q14839 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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CHD4Q14839 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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CHD4Q14839 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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CHD4Q14839 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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