Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SMC1AQ14683 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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