Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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