Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SCARF1Q14162 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms