Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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COL9A3Q14050 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
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COL9A3Q14050 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
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COL9A3Q14050 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
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COL9A3Q14050 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
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COL9A3Q14050 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
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COL9A3Q14050 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
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COL9A3Q14050 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
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COL9A3Q14050 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
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COL9A3Q14050 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
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COL9A3Q14050 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
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COL9A3Q14050 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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COL9A3Q14050 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
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COL9A3Q14050 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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COL9A3Q14050 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
COL9A3Q14050 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
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