Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKP1Q13835 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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PKP1Q13835 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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PKP1Q13835 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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PKP1Q13835 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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PKP1Q13835 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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