Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
APOFQ13790 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
APOFQ13790 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
APOFQ13790 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
APOFQ13790 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
APOFQ13790 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
APOFQ13790 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
APOFQ13790 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
APOFQ13790 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
APOFQ13790 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
APOFQ13790 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
APOFQ13790 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
APOFQ13790 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
APOFQ13790 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
APOFQ13790 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
APOFQ13790 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
APOFQ13790 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
APOFQ13790 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
APOFQ13790 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
APOFQ13790 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
APOFQ13790 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
APOFQ13790 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
APOFQ13790 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
APOFQ13790 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
APOFQ13790 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
APOFQ13790 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
APOFQ13790 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
APOFQ13790 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
APOFQ13790 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
APOFQ13790 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
APOFQ13790 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
APOFQ13790 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
APOFQ13790 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
APOFQ13790 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
APOFQ13790 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
APOFQ13790 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
APOFQ13790 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
APOFQ13790 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
APOFQ13790 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
APOFQ13790 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
APOFQ13790 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
APOFQ13790 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
APOFQ13790 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
APOFQ13790 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
APOFQ13790 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
APOFQ13790 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
APOFQ13790 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
APOFQ13790 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
APOFQ13790 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
APOFQ13790 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
APOFQ13790 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
APOFQ13790 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
APOFQ13790 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
APOFQ13790 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
APOFQ13790 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms